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4D蛋白组学

相比传统DIA蛋白质组学技术,4D-DIA得到的真实谱图库覆盖度更高,采集得到的谱图更多,有助于蛋白鉴定数量的提升,全新的4D-DIA蛋白质组学能够全面提升蛋白质鉴定能力、检测灵敏度和数据完整性,展现了其在蛋白质组学领域的强大功能和广泛应用前景,具有划时代的重大意义。
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产品简介
桑格4D-DIA 蛋白质组学基于timsTOF HT/Ultra2仪器平台以及PASEF技术,相比传统DIA蛋白质组学技术,4D-DIA得到的真实谱图库覆盖度更高,采集得到的谱图更多,有助于蛋白鉴定数量的提升,全新的4D-DIA蛋白质组学能够系统性提升蛋白质鉴定能力、检测灵敏度和数据完整性,展现了其在蛋白质组学领域的强大功能和广泛应用前景,具有划时代的重大意义。
产品优势
与传统的DIA技术相比,4D-DIA 采集模式数据采集具有以下优点:
优势1
灵敏度更高
检测实现近乎100%的离子利用率,提升检测灵敏度
优势2
检测更精准
4D-DIA检测技术,实现更高的检测深度和覆盖度
优势3
质量有保障
定量重复性、完整性、可靠性得到系统提升
技术流程
应用领域
样本要求
案例分析
小鼠脑内皮的蛋白质组学揭示了衰老过程中囊泡运输途径的失调
  • 英文题目:Proteomics of mouse brain endothelium uncovers dysregulation of vesicular transport pathways during aging
    期刊:Nature Aging
    IF=19.4
    发表时间:2024
    项目:4D-DIA蛋白质组学
    研究方向:衰老
    DOI:10.1038/s43587-024-00598-z
研究背景
随着年龄增长,脑内皮细胞(BEC)功能的下降对神经退行性疾病有重要影响。尽管已有BEC转录组图谱,但其仍匮乏蛋白质组研究。为揭示衰老对内皮细胞功能的影响,本研究开发了基于磁性激活细胞分选的BEC富集方法,结合蛋白组技术,揭示了与年龄相关的蛋白质动态变化及其生物学功能。
技术路线
重要结论
共收集不同年龄(3,6,12,18月龄)小鼠的BEC细胞进行了蛋白质组学分析,结果发现其中2,516种蛋白质在所有年龄组的三个或更多样品中被定量,其中850种蛋白质在存在显著的丰度变化。并使用贝叶斯非参数时间序列模型将蛋白分为16个簇,发现与囊泡介导的运输过程相关的蛋白质在衰老过程中表现出持续下调。 进一步针对囊泡运输途径相关蛋白进行数据挖掘,其中Arf6这一囊泡运输过程关键调控因子下调最显著,并通过细胞实验验证了Arf6在衰老过程中减少,表明Arf6可能在衰老过程调控中发挥关键作用。
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