- 微生物
- DNA
- 转录与调控
- 单细胞空间组
- 蛋白与代谢
- 常规测序
产品简介
真菌基因组扫描图，通过Novaseq X Plus或DNBSEQ-T7等二代测序平台，获得基因组的序列信息，并利用生物信息分析技术进行序列的基因预测及功能注释。研究较多的真菌主要包括模式真菌、动植物病原真菌及工业生产用真菌等，组学水平上研究热点集中在未测序物种的结构基因组学解析、代谢与调控系统解析、致病系统解析等。
产品优势
- 优势1
- 真菌基因组云流程交付，分析内容完备，随时随地做交互分析
- 9大分析模块，28项分析内容，全面解析基因组结构、基因组基础元件和比较基因组分析
- 优势2
- 软件、参数自定义，一键定制个性化分析结果
- 一键生成高质量期刊图表，结果呈图更美观，数据挖掘更省时
- 优势3
- 14种功能数据库注释，深入挖掘功能信息，多角度解释科学问题
- 6大通用数据库，8项专用数据库，多角度挖掘基因功能信息，实现对分子机制及表型与功能的深度探索
- 优势4
- 除便捷的真菌基因组云流程外，桑格也有上百款云工具，造福广大科研人员
- 400+款云分析工具，涵盖数据统计，可视化绘图，个性化分析等，满足您的各种组学需求
技术流程
结果展示
K-mer频率分布分析统计k-mer深度及各个深度所占的比例，以此评估基因组大小，基因组的杂合度和重复度
结果展示
应用领域
样本要求
注：详细取样指导，请联系我司技术人员
案例分析
Antarcticomyces pellizarae的全基因组测序揭示了一种冰结合蛋白，及罕见的次级代谢产物基因簇，为Thelebolales的系统发育提供了见解
- Whole-genome sequencing of the endemic Antarctic fungus Antarctomyces pellizariae reveals an ice-binding protein, a scarce set of secondary metabolites gene clusters and provides insights on Thelebolales phylogeny 期刊：Genomics IF：4.4 发表时间：2020 DOI： 10.1016/j.ygeno.2020.05.004
研究结果
从南极雪中分离出嗜冷真菌Antarctomyces pellizariae ，并对A. pellizariae UFMGCB 12416进行基因组测序，鉴定了一个由236个氨基酸组成的冰结合蛋白编码基因，绘制了次级代谢物基因簇，并从数百个直系同源单拷贝蛋白的比对中重建了A.pellizariae与其他Leotiomycetes的系统发育关系，加深了对微生物冰结合蛋白和嗜冷真菌基因组方面的理解。
卵形孢球托霉基因组草图揭示了有助于其生物降解潜力的基因
- Draft genome of Gongronella butleri reveals the genes contributing to its biodegradation potential 期刊：Journal of Genetic Engineering and Biotechnology IF：3.5 发表时间：2022 DOI： 10.1186/s43141-022-00351-2
研究结果
卵形孢球托霉是一种具有许多工业应用的真菌，从有机堆肥中分离和纯化的卵形孢球托霉 GbKAU菌株，基因组测序组装得到44639个scaffolds，基因组大小为29.8Mb，包含11428个基因。KEGG注释将这些基因分为359个参与不同途径的组，其中14个属于参与大分子降解的酶。GO注释、SSR分析和变异分析揭示了基因组的主要分子特征。与先前测序菌株的比较分析表明，它们具有数量相当的基因和相似的酶。研究结果揭示了有助于其生物降解潜力的基因和途径。
