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产品简介
单细胞ATAC：在单个细胞水平上测量染色质的开放性，从而揭示细胞之间的异质性以及基因调控网络的动态变化。
通过对单个细胞中基因座（转录开合区域、启动子、增强子等）的开放性状态研究，有助于揭示细胞类型、亚群、细胞分化过程以及细胞在不同环境中的反应。
这项技术在研究转录因子结合、染色质状态以及基因调控网络中的动态变化方面具有重要意义。
产品优势
- 优势1
- 超高通量
- 每个样本检测的细胞核数可达3000-10000
- 优势2
- 方便快捷
- 10分钟内可完成上万细胞核的捕获
- 优势3
- 灵敏度高
- 细胞核捕获率超过65%
技术流程
技术流程
分析流程
样本要求
案例分析
单核多组分析揭示人主动脉根部瘤表型调节的基因调控动力学
- IF=15.1 发表时间：2024.03 技术手段：snATAC-seq&snRNA-seq&10x Visium 研究方向：疾病发生发展 DOI：10.1002/advs.202400444
研究背景
主动脉根部瘤是一种可能危及生命的疾病，可能导致主动脉破裂，通常与遗传综合征有关，如马凡综合征（MFS）。尽管MFS动物模型的研究为主动脉根部瘤的发病机制提供了有价值的见解，但对人类主动脉根组织转录组学和表观遗传学的理解仍然不透彻，这种限制阻碍了有效靶向疗法的发展。
实验设计
研究结果展示
本研究首次对健康和MFS条件下人主动脉根组织的单核多组学和空间转录组测序数据进行了综合分析。鉴定了人主动脉根部的细胞类型特异性转录组模式和顺式调节图谱。描述了血管平滑肌细胞（VSMC）表型调节过程中的转录调控和空间动态，血管平滑肌细胞 （VSMC） 是主动脉壁的主要细胞类型。FOXN3被确定为维持人主动脉VSMC收缩表型的新型关键调节因子，可作为潜在的治疗靶点。这些发现为人类动脉瘤主动脉根部表型调节过程中的转录调控和空间动态提供了新的见解。
常见问题
- 生物学重复要不要设置？
- 图谱类文章可以不做生物学重复（1个样本也可以）；临床样本（人）最起码3个生物学重复；模式生物（小鼠、大鼠）尽量做生物学重复。若样本量不足，同一处理也可以混样测序。
