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细菌基因组
描述说明:细菌基因组denovo测序,即从头测序,指在不依赖任何参考序列的情况下,对细菌基因组进行测序,利用生物信息学手段从头组装得到基因组序列。根据最终基因组组装完整程度的不同,将细菌基因组denovo测序分为扫描图测序和完成图测序。
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产品介绍 分析流程 更新日志

1、首家细菌基因组分析交互式云平台 

美吉生物首发细菌基因组分析交互式云平台,让你随时随地做科研,轻轻松松玩转细菌基因组分析 

 

2、细菌基因组云平台内置10大分析模块,37项交互内容,提供系统、全面的细菌基因组分析平台 

全面系统的生信分析,涵盖基因组组装、七大功能注释、基因序列全方位分析、致病系统分析、代谢系统分析、可移动元件分析、基因组图谱个性化定制等主要功能。 

 

3、“零”生信,照样玩转基因组 

不懂Linux、perl、python语言没关系,只需选择样本、参数设置、运行即可,轻轻松松做分析达人,各类分析不再“求人”,质量周期全把控。  

 

4、基因组分析可视化,分析图表DIY+各类花式下载,文章、报告统统搞定 

基因组数据可视化,全局把控,全面分析,不再身陷海量数据,摆脱“只缘身在此山中”的无奈,从此你也可以“指点江山,运筹帷幄”。细菌基因组云平台支持多种格式图表下载、编辑功能;立体化数据查询,省时、省力。 

 

5、内置实用小工具,序列编辑轻松搞定 

原序列、反向序列、反向互补序列随意截取,云平台与NCBI一键链接,序列比对简便快捷。 


当前版本为第一版


1、基于16S和看家基因的样本进化分析


2、gbk文件生成


3、测序数据质控


4、基因组GC-depth分布分析、K-mer频率分布分析、基因组大小评估


5、基因组组装与预测:编码基因预测、tRNA预测、rRNA预测、重复基因预测


6、七大功能注释:参考基因组注释、NR注释、Swiss-Prot注释、Pfam注释、COG注释、GO注释、KEGG注释


7、结构基因组查询:启动子预测、旁系同源基因、基因组图谱、基因搜索


8、可移动元件分析:基因组岛分析、前噬菌体预测、CRISPR-Cas分析


9、基因组圈图分析:GView基因组圈图、Circos基因组圈图


10、代谢系统分析:碳水化合物活性酶注释、次级代谢产物合成分析


11、致病系统分析:毒力基因预测、耐药基因预测、病原菌宿主互作分析、分泌系统分析、分泌蛋白分析、转运蛋白分析、跨膜蛋白预测


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