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遗传进化云分析
描述说明:进化遗传学(evolutional genetics)是研究群体的遗传结构及其变化规律的遗传学分支学科。它应用数学和统计学方法研究群体中基因频率和基因型频率以及影响这些频率的选择效应和突变作用,还研究迁移和遗传漂变等与遗传结构的关系,由此来探讨进化的机制。通过全基因组关联分析,可以对性状进行精细定位。
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自然群体,65个样本,3个分组 获取
产品介绍 分析流程

进化遗传学关心的是一个群体的遗传结构、变化规律,以及自然/人工选择在其中所起的作用。典型的遗传进化分析项目,其分析内容大致包括:群体结构(Population genetic structure)、连锁不平衡(Linkage disequilibriumLD)、选择性消除(Selective sweep)、种群历史(Population history)等;对于某些数据符合要求的材料,还可以执行全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)等性状关联基因定位研究。

在Illumina Hiseq测序数据(Raw Data)下机之后,对下机数据进行质量控制,过滤其中低质量的数据,获得高质量的数据(Clean Data)。接着,基于在测序群体中开发的SNP和InDel分子标记,进一步进行遗传多样性、遗传结构、选择性消除、连锁不平衡、种群历史和全基因组关联分析等进化和性状定位相关研究。


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