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原核转录组分析流程

  • 原核转录组是从RNA水平研究基因表达的情况,通过细菌转录组比较分析,研究细菌在不同环境、宿主等情况下的基因表达变化,从而阐述宿主、环境对细菌的影响、细菌致病机制等。还可以深入挖掘sRNA和基因结构的信息,进一步为基因网络调控的研究提供有力支持。

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原核转录组是从RNA水平研究基因表达的情况,通过细菌转录组比较分析,研究细菌在不同环境、宿主等情况下的基因表达变化,从而阐述宿主、环境对细菌的影响、细菌致病机制等。还可以深入挖掘sRNA和基因结构的信息,进一步为基因网络调控的研究提供有力支持。

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微生物多样性流程

  • 物种组成分析
  • 样本比较分析
  • 物种差异分析
  • 关联与模型预测
  • 16S功能预测

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微生物多样性分析流程,基于二代测序平台,对16S rDNA/18S rDNA/ITS/功能基因等特定区段PCR产物进行高通量测序,探究环境样本中的微生物群落结构、进化关系以及微生物与环境相关性等信息。

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细菌基因组

  • 进化树分析
  • 参考基因组注释
  • 基因组图谱
  • 可移动元件分析
  • 基因组圈图
  • 次级代谢产物合成分析
  • 致病系统分析

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细菌基因组denovo测序,即从头测序,指在不依赖任何参考序列的情况下,对细菌基因组进行测序,利用生物信息学手段从头组装得到基因组序列。根据最终基因组组装完整程度的不同,将细菌基因组denovo测序分为扫描图测序和完成图测序。

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真核有参转录组云分析流程

  • 差异表达分析
  • 新转录本预测
  • 目标基因集分析
  • 可变剪接分析
  • SNP分析

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真核有参转录组流程,根据真核生物参考基因组,针对高通量测序数据进行表达量计算,获得基因表达差异及差异基因功能富集等信息,定量描述RNA世界,探索基因表达奥秘。

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